“隱性黨員”的“梳出”和“歸位”，可謂基層黨建的“階段大捷”。然而，“隱性黨員”從何而來，因何而生，為什么沒有黨組織承接？沿著這一思路，市委著眼于基層黨建“科學發展，探索規律，整體推進”的這一總體要求，把“隱性黨員”問題“放大”并置于經濟制度改革和社會結構調整的大環境中，組織力量深入社區、新經濟組織、新社會組織和農村、國有企業、機關事業單位進行思考和調研，探求黨員與黨組織，黨組織與其他經濟組織、政治組織、社會組織、群眾自治組織等基層組織的相互關系、相互作用等，對其產生的社會背景、經濟條件，對新興市場經濟組織的形成過程以及歷史定位，進行理性分析和科學判斷，逐步形成共識：“隱性黨員”有在國企改革中產生的，這是經濟制度改革造成的；也有從行政管理體制深化和機關事業單位職能轉換與還原過程中分流出來的，這是社會結構調整造成的；還有在農村富裕勞動力向城市轉移，城市中“單位人”變成“社會人”過程中出現的，這是農村城市化進程加快和城市管理重心下移造成的。“隱性黨員”游離于黨組織管理之外，造成了黨員與黨組織相“分離”。與此相對應，隨著市場經濟體制的建立和完善，黨的基層組織與其所依附的其他經濟社會組織長期形成的傳統格局發生了根本性改變，原有的各種經濟社會組織體系出現嚴重分化，改變了基層黨組織所依附的經濟和社會的組織基礎，造成了基層黨組織架構沒有及時與新興市場經濟組織架構相匹配，基層黨組織與應由其領導的其他基層組織相“脫節”。“分離”與“脫節”產生于經濟制度改革和社會結構調整進程中，涉及經濟、政治、社會、文化等各個方面，構成了市場經濟條件下基層黨建的兩個基本問題。

兩個基本問題在黨的基層黨組織建設史上前所未有，給基層黨建工作帶來的影響重大，為全黨全社會所重視和關注更是空前。

從“架構組織體系”到確立目標模式

如果單從“找黨員”和“建組織”看，兩個基本問題屬于黨的自身建設問題。然而，從黨的基層組織與其他基層組織的關系作用和黨在發展市場經濟中所承擔的歷史使命看，兩個基本問題又是加強黨的先進性建設和執政能力建設的基礎。由于它因市場經濟組織不斷衍生、演化而生，因此，解決這一問題，就不能滿足于階段性的“工作成效”，也不能就事論事追求工作政績的立竿見影。而要按照科學發展觀要求，站在加強黨的先進性建設和黨的執政能力建設的“兩個高度”，從經濟、政治、社會、文化等各方面科學論證，尋找規律，系統解決，通過建立健全與市場經濟體制相適應、與市場經濟組織架構相匹配的基層黨組織架構和工作新秩序，推動基層黨的建設全面、協調、有序地發展。