據臺灣媒體此前的報道，2009年5月初，馬英九視察海基會時曾表示，兩岸交流頻繁，也許可考慮雙方某些項目上互設機構。

《中國時報》今天也刊發特稿《兩會互設機構 符合兩岸現實》指出，依照兩岸交流新形勢的最新發展規律，有關兩會互設機構的商談時機，即將提上兩會的議事日程。這項關鍵的談判工程，不僅攸關今后兩會商談的基本格局與操作模式，更將是推進兩岸關系和平發展的歷史性進程。

文章說，隨著兩岸經貿交流合作、兩岸觀光客增多，各項衍生事務持續爆增，如果無法盡早互設代表機構，相關問題的處理恐難以有效照顧兩岸人民的權益。維系兩岸和平發展的大局，鞏固兩岸和平發展的勢頭，已成為中共對臺工作與貫徹胡錦濤六點建議重要講話精神的“中心任務”。有關兩岸兩會互設機構的政策思路，即成為國臺辦與海協會今后推動商談的首要目標。相對地，這也是馬英九當局突破兩岸發展格局的必經之路。

文章指出，有關兩會互設機構的評估，從推動交流、服務、協商等功能來看，都是符合兩岸現實所需的。